論文專(zhuān)著:
出版專(zhuān)著:
[1] 邱德有、朱澂編著,《抗癌藥物紫杉醇》,北京:北京大學(xué)出版社,1996。
[2] 黃璐琦主編,邱德有、梁宗鎖、陳敏副主編,《丹參大全-丹參植物學(xué)研究》, 北京:人民衛(wèi)生出版社,2008。
[3] 黃璐琦主編《分子生藥學(xué)》(第二版), 編委,北京:北京大學(xué)醫(yī)學(xué)出版社,2006。
[4] 高文遠(yuǎn)、賈偉主編、黃璐琦、邱德有副主編,《藥用植物克隆培養(yǎng)及工業(yè)化生產(chǎn)》, 北京:化學(xué)工業(yè)出版社,2005。
發(fā)表英文論文:
[1] Fenjuan Shao, Qiang Lu, Iain W. Wilson, and Deyou Qiu. Genome-wide identification and characterization of the SPL gene family in Ziziphus jujuba. Gene, 2017, 627:315-21.
[2] Fenjuan Shao, Qian Zhang, Hongwei Liu, Shanfa Lu, Deyou Qiu. Genome-wide identification and analysis of microRNAs involved in witches'-broom phytoplasma response in Ziziphus jujuba,PLOS ONE, 2016, 11(11): e0166099
[3] Zhang Q#, Liu H#, Sun G, Wilson IW, Wu J, Hoffman A, Cheng J, Qiu D*.Baseline survey of root-associated microbes of Taxus chinensis (Pilger) Rehd. PloS one, 2015, 10(3): e0123026
[4] Shao F, Qiu D, Lu S*. Comparative analysis of the Dicer-like gene family reveals loss of miR162 target site in SmDCL1 from Salvia miltiorrhiza. Scientific Reports,2015, 5: 09891
[5] Yang Yanfang, Zhao Hainan, Roberto A Barrero, Zhang Baohong, Sun Guiling, Wilson Iain W, Xie Fuliang, Walker Kevin D, Parks Joshua W, Bruce Robert, Guo Guangwu, Chen Li, Zhang Yong, Huang Xin, Tang Qi, Liu Hongwei, Bellgard Matthew I, Qiu Deyou*, Lai Jinsheng*, Hoffman Angela*. Genome sequencing and analysis of the paclitaxel-producing endophytic fungus Penicillium aurantiogriseum NRRL 62431. BMC Genomics, 2014, 15: 1-14.(* 通訊作者)
[6] Zhang Nan, Han Zhentai, Sun Guiling, Hoffman Angela, Wilson Iain W, Yang Yanfang, Gao Qian, Wu Jianqiang, Xie Dan, Dai Jungui, Qiu Deyou*. Molecular cloning and characterization of a cytochrome P450 taxoid 9á-hydroxylase in Ginkgo biloba cells. BBRC, 2014, 443: 938-943.(* 通訊作者)
[7] Guo Q, Ma X*, Wei S, Qiu D, Iain W, Wu P, Tang Q, Liu L, Dong S, Zu W*. De novo transcriptome sequencing and digital gene expression analysis predict biosynthetic pathway of rhynchophylline and isorhynchophylline from Uncaria rhynchophylla, a non-model plant with potent anti-alzheimer‟s properties. BMC Genomics, 2014, 15: 676
[8] Sun Guiling, Yang Yanfang ?, Xie Fuliang, Wen Jianfan, Wu Jianqiang, Wilson Iain W, Tang Qi, Liu Hongwei, Qiu Deyou*. Deep sequencing reveals transcriptome re-programming of Taxus × media cells to the elicitation with methyl jasmonate. PLoS One, 2013, 8(4):e62865 (?共同第一作者).(* 通訊作者)
[9] Xie Fuliang, Burklew Caitlin E, Yang Yanfang, Liu Min, Xiao Peng, Zhang Baohong*, Qiu Deyou*. De novo sequencing and a comprehensive analysis of purple sweet potato (Impomoea batatas L.) transcriptome. Planta, 2012,236(1): 101-113.(* 通訊作者)
[10] Tang Qi, Su Zhiheng, Ma Xiaojun, Xu Derong, Liang Yanhai, Cao Haibo, Wang Xuesong, Qu Xiaoying, Hoffman Angela*, Liu Honhwei, Gu Dizhou, Qiu Deyou*. LC-MS method for detecting prostratin in plant extracts and identification of a high-yielding population of Euphorbia fischeriana. Phytochemistry Letters, 2012, 5(1): 214: 218.(* 通訊作者)
[11] Tang Qi, Ma Xiaojun*, Mo Changming, Wilson Iain W, Song Cai, Zhao Huan, Yang Yanfang, Fu Wei, Qiu Deyou*. An efficient approach to finding Siraitia grosvenorii triterpene biosynthetic genes by RNA-seq and digital gene expression analysis. BMC Genomics, 2011, 12: 343.(* 通訊作者)
[12] Roberto A Barrero, Chapman B, Yang Yanfang, Moolhuijzen P, Keeble-Gagnère G, Zhang Nan, Tang Qi, Bellgard Matthew I*, Qiu Deyou*. De novo assembly of Euphorbia fischeriana root transcriptome identifies prostratin pathway related genes. BMC Genomics, 2011, 12: 600.(* 通訊作者)
[13] Wang Qiong, Chen Jienan*, Zhang Huaiyun, Lu Mengzhu, Qiu Deyou, Wen Yafeng, Kong Qianqian. Synthesis of Water Soluble Quantum Dots for Monitoring Carrier-DNA Nanoparticles in Plant Cells. Journal of Nanoscience and Nanotechnology, 2011, 11(3): 2208-2214(7). (* 通訊作者)
[14] Li Fenglan, Ma Xiaojun, Hu Xinling, Hoffman Angela, Dai Jungui, Qiu Deyou*. Antisense-induced suppression of taxoid 14β-hydroxylase gene expression in transgenic Taxus × media cells. Journal of African Biotechnology, 2011, 10: 8720-8728.(* 通訊作者)
[15]Qiu Deyou*, Pan Xiaoping, Wilson Iain W*, Li Fenglan, Liu Min, Teng Wenjing, Zhang Baohong*. High throughput sequencing technology reveals that the taxoid elicitor methyl jasmonate regulates microRNA expression in Chinese yew (Taxus chinensis). Gene, 2009, 436(1-2):37-44.(* 通訊作者)
[16] Qiu Deyou, Wilson Iain W, Gan Siming, Washusen Russell, Moran Gavin F, Southerton Simon G*. Gene expression in Eucalyptus branch wood with marked variation in cellulose microfibril orientation and lacking G-layers. New Phytologist, 2008, 179: 94-103(* 通訊作者).
[17] Spokevicius Antanas V, Southerton Simon G, MacMillan Colleen P, Qiu Deyou, Gan Siming, Tibbits Josquin FG, Moran Gavin F, Bossinger Gerd*. β-tubulin controls cellulose microfibril orientation in plant secondary fibre cell walls. The Plant Journal, 2007, 51(4): 717-726(* 通訊作者).
[18] Ketchum Raymond EB, Horiguchi Tohru, Qiu Deyou, Williams Robert M, Croteau Rodeny B*. Administering cultured Taxus cells with early precursors reveals bifurcations in the taxoid biosynthetic pathway. Phytochemistry, 2007, 68(3):335-341(* 通訊作者).
[19] Ketchum Raymond EB, Rithner Christopher D, Qiu Deyou, Kim Yousun, Williams Robert M, Croteau Rodeny*. Taxus metabolomics: methyl jasmonate preferentially induces taxoids oxygenated at C-13 in Taxus × media cell cultures. Phytochemistry, 2003, 62:901-909(* 通訊作者).
[20] Wang Lida, Qiu Deyou, Chen Jiyun, Han Yifan, Zheng Junhua, Guo De-an*. Callus cultures of Annona squamosa for the production of annonaceous acetogenins. Journal of Asian Natural Products Research, 2002, 4 (3):171-174(* 通訊作者).
[21] Moran G. F.,Thamarus K.A., Raymond C.A., Qiu D.Y.,Uren T., Southerton S.G.,2002, Genomics of Eucalyptus wood traits. Annals of Forest Science,59(5):645-649.
[22] Zhang Junzeng, Zhang Lihe, Wang Xihong, Qiu Deyou, Sun Dian, Gu Jianqiao, Fang Qicheng*. Microbial transformation of 10-deacetyl-7-epitaxol and 1β-hydroxybaccatin I by some fungi from the inner bark of Taxus yunnanensis, Journal of Natural Products, 1998, 61: 497-500.(* 通訊作者).
[23] Zhang Junzeng, Tu Fu, Zhang Lihe*, Qiu Deyou. The Epimerization of 10-Deacetylbaccatin Ⅲ by Microsphaeropsis Onychiuri a Fungus from Taxus Yunnanensis. Chinese Chemical Letters, 1997, 8(1): 47-48(* 通訊作者).
[24] Qiu D Y.,Zhou W.Y.,1995,Identification of homozygotes deived from anthers of asparagus(Asparagus officianalis L.), Acta Horticulture, 402:398-402.
發(fā)表中文期刊論文:
[1]豐美靜,張愷愷,黃中文,邱德有,陳段芬,楊艷芳.東北紅豆杉溫室扦插繁殖試驗(yàn)[J].北方園藝,2020(13):65-70.
[2]蔣路園,王旭,張愷愷,陳段芬,邱德有,楊艷芳.紅豆杉TcERF基因qRT-PCR體系構(gòu)建與優(yōu)化[J].農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào),2020,28(06):1096-1104.
[3]張愷愷,呂星,楊立瑩,陳段芬,邱德有,楊艷芳.紅豆杉TbAP2基因熒光定量PCR體系的建立及優(yōu)化[J].林業(yè)科學(xué)研究,2019,32(01):39-46.
[4]張愷愷,李清,惠楠,陳段芬,邱德有,楊艷芳.紅豆杉總RNA提取方法的比較[J].分子植物育種,2019,17(18):5993-5999.
[5]蘆強(qiáng),邵芬娟,邱德有.毛果楊LBD基因家族的全基因組分析[J].基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué),2018,37(01):313-325.
[6]蘆強(qiáng),邵芬娟,邱德有.雷蒙德氏棉LBD基因家族的鑒定及進(jìn)化表達(dá)分析[J].分子植物育種,2017,15(11):4308-4324.
[7]楊艷芳,劉洪偉,邱德有.基于高通量測(cè)序的瑞香狼毒轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析[J].中草藥,2017,48(22):4740-4747.
[8]王帥,邵芬娟,李論,蘆強(qiáng),邱德有.穗花杉的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及其轉(zhuǎn)錄組特性分析[J].林業(yè)科學(xué)研究,2017,30(05):759-764.
[9]劉洪偉,王帥,王強(qiáng),王偉,楊艷芳,劉錫葵,邱德有.甜菜樹(shù)貝殼杉烯合酶基因的克隆與原核表達(dá)[J].食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào),2017,36(05):479-485.
[10]王帥,趙中槐,董清華,邵芬娟,蘆強(qiáng),邱德有.香榧中不存在紫杉醇的化學(xué)及分子生物學(xué)證據(jù)[J].基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué),2016,35(11):3172-3177.
[11]劉洪偉,楊艷芳,熊王丹,吳平治,吳國(guó)江,邱德有.不同植物中推定蓖麻烯合酶基因的生物信息學(xué)分析[J].植物研究,2016,36(04):605-612.
[12]劉洪偉,楊艷芳,李艷艷,王帥,邱德有.榛子產(chǎn)紫杉醇內(nèi)生真菌Penicillium aurantiogriseum中GGPP合酶基因的克隆與表達(dá)[J].廣西植物,2016,36(04):456-461+506.
[13]王帥,邵芬娟,李論,蘆強(qiáng),邱德有.穗花杉中不存在紫杉醇的化學(xué)及分子生物學(xué)證據(jù)[J].西北植物學(xué)報(bào),2016,36(04):661-666.
[14]程俊文,賀亮,鄒景泉,方茹,邱德有,胡傳久,魏海龍,蔣云鶴,王衍彬.響應(yīng)面法優(yōu)化內(nèi)生真菌發(fā)酵產(chǎn)紫杉醇工藝[J].浙江林業(yè)科技,2015,35(06):68-72.
[15]李艷艷,楊艷芳,王俊青,王帥,劉洪偉,邱德有.紅豆杉TcLBDs基因的克隆與表達(dá)分析[J].林業(yè)科學(xué),2015,51(10):126-133.
[16]李艷艷,楊艷芳,劉洪偉,王帥,邱德有.中國(guó)紅豆杉TcAPLs基因的克隆及表達(dá)分析[J].中草藥,2015,46(10):1512-1519.
[17]邱德有,張彬,楊艷芳,邵芬娟,滕文靜.紫杉醇生物合成研究歷史、現(xiàn)狀及展望[J].生物技術(shù)通報(bào),2015,31(04):56-64.
[18]周華,朱祺,楊艷芳,劉洪偉,余發(fā)新,邱德有.南方紅豆杉bHLH基因克隆與序列分析[J].植物研究,2015,35(01):52-59.
[19]楊艷芳,劉洪偉,邱德有.歐洲紅豆杉AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子基因序列分析[J].氨基酸和生物資源,2014,36(04):54-59.
[20]周華,朱祺,楊艷芳,余發(fā)新,邱德有.紅豆杉分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J].植物生理學(xué)報(bào),2014,50(04):373-381.
[21]張楠,孫桂玲,戴均貴,楊艷芳,劉洪偉,邱德有.銀杏細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序及分析[J].中國(guó)生物工程雜志,2013,33(05):112-119.
[22]曹秀萍,鄒建華,邱德有,戴均貴.虎眼萬(wàn)年青屬植物Ornithogalum thyrsoide的甾體皂苷及黃酮類(lèi)化學(xué)成分[J].天然產(chǎn)物研究與開(kāi)發(fā),2012,24(06):768-771.
[23]劉洪偉,唐其,楊艷芳,張楠,邱德有.從狼毒大戟中克隆蓖麻烯合成酶基因[J].分子植物育種,2012,10(01):62-66. 通訊作者
[24]顧地周,楊麗娟,馮穎,姜云天,高捍東,邱德有.延緩生長(zhǎng)法在試管內(nèi)保存牛皮杜鵑種質(zhì)初探[J].科技通報(bào),2011,27(04):546-548+590.
[25]唐其,邱德有,馬小軍,莫長(zhǎng)明,付偉.羅漢果果實(shí)不同發(fā)育時(shí)期SSH文庫(kù)的構(gòu)建[J].廣西植物,2011,31(03):388-392.
[26]顧地周,高捍東,邱德有.延緩生長(zhǎng)法保存長(zhǎng)白山珍稀植物玫瑰種質(zhì)初探[J].中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào),2010,30(07):91-93+104.
[27]顧地周,高捍東,邱德有.應(yīng)用“促成休眠”法試管內(nèi)保存東北刺人參種質(zhì)[J].東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2010,38(03):126-127.
[28]許德榮,唐其,梁延海,曹海波,王雪松,趙厚坤,李云龍,劉光,劉官久,邱德有.狼毒大戟cDNA文庫(kù)構(gòu)建及EST測(cè)序[J].分子植物育種,2010,8(01):139-144. 通訊作者
[29]邱德有,吳小紅,黃璐琦.木本藥用植物紅豆杉研究的新進(jìn)展[J].林業(yè)科學(xué)研究,2009,22(03):439-445.
[30]李鳳嵐,邱德有,馬小軍,劉敏,許德榮.利用RNAi抑制曼地亞紅豆杉細(xì)胞紫杉烷14β-羥基化酶基因的表達(dá)[J].中國(guó)生物工程雜志,2009,29(05):55-60. 通訊作者
[31]劉敏,滕文靜,董清華,晁慧娟,李鳳嵐,邱德有.草莓果實(shí)外源基因瞬時(shí)表達(dá)系統(tǒng)的建立[J].果樹(shù)學(xué)報(bào),2009,26(01):60-65+130. 通訊作者
[32]呂冬梅,袁媛,黃璐琦,梁日欣,邱德有.丹參毛狀根不同培養(yǎng)時(shí)期有效成分的積累研究[J].中國(guó)中藥雜志,2008(09):1078-1080.
[33]呂冬梅,袁媛,張東,黃璐琦,梁日欣,邱德有.丹參毛狀根化學(xué)成分穩(wěn)定性研究[J].中國(guó)中藥雜志,2008(06):653-656.
[34]滕文靜,胡新玲,王偉,程克棣,邱德有.紫杉烷13α-羥基化酶基因的克隆及其轉(zhuǎn)化煙草的研究[J].中國(guó)生物工程雜志,2008(02):53-58. 通訊作者
[35]金曉磊,沈元月,胡新玲,滕文靜,董清華,邱德有.草莓基因工程研究進(jìn)展[J].果樹(shù)學(xué)報(bào),2007(04):506-512. 通訊作者
[36]崔光紅,黃璐琦,邱德有,袁媛,付桂芳.丹參功能基因組學(xué)研究Ⅱ——丹參毛狀根不同時(shí)期基因表達(dá)譜分析[J].中國(guó)中藥雜志,2007,32(13):1267-1272. 通訊作者
[37]崔光紅,黃璐琦,唐曉晶,邱德有,王學(xué)勇,付桂芳.丹參功能基因組學(xué)研究Ⅰ——cDNA芯片的構(gòu)建[J].中國(guó)中藥雜志,2007,32(12):1137-1141. 通訊作者
[38]王學(xué)勇,崔光紅,黃璐琦,邱德有.誘導(dǎo)子對(duì)丹參毛狀根中丹參酮類(lèi)成分積累影響[J].中國(guó)中藥雜志,2007,32(10):976-978. 通訊作者
[39]毛瑩,崔光紅,黃璐琦,邱德有,劉娟.銅、鋅離子影響丹參金屬硫蛋白MT2基因表達(dá)[J].分子植物育種,2007,5(03):389-392. 通訊作者
[40]王學(xué)勇,崔光紅,黃璐琦,邱德有.茉莉酸甲酯對(duì)丹參毛狀根中丹參酮類(lèi)成分積累和釋放的影響[J].中國(guó)中藥雜志,2007,32(04):300-302. 通訊作者
[41]黃新,邱德有,黃璐琦.茉莉酸甲酯對(duì)中國(guó)紅豆杉細(xì)胞基因表達(dá)的mRNA差異顯示研究[J].分子植物育種,2006(05):627-632.
[42]胡新玲,徐妙云,劉德虎,邱德有.紫杉烷14β-羥基化酶基因片段的克隆及其植物表達(dá)載體的構(gòu)建[J].分子植物育種,2006(02):243-250.
[43]邱德有,宋經(jīng)元,馬小軍,祁建軍,張蔭麟.丹參毛狀根生物反應(yīng)器大規(guī)模培養(yǎng)的研究[J].分子植物育種,2004,2(05):699-703.
[44]邱德有,黃璐琦.代謝組學(xué)研究——功能基因組學(xué)研究的重要組成部分[J].分子植物育種,2004,2(02):165-177.
[45]黃新,黃璐琦,邱德有.紫杉醇生物合成途徑中相關(guān)酶的研究進(jìn)展[J].中國(guó)生物工程雜志,2002,22(05):27-33.
[46]邱德有,吳小紅,黃璐琦.現(xiàn)代生命科學(xué)技術(shù)對(duì)中醫(yī)藥發(fā)展的影響[J].世界科學(xué)技術(shù),2001(02):12-16+63-64.
[47]邱德有.試論藥用植物有效成分基因調(diào)控的研究進(jìn)展[J].世界科學(xué)技術(shù),2000,2(03):30-34.
[48]邱德有,朱蔚華,吳蘊(yùn)祺,張大勇,胡秋.利用茉莉酸類(lèi)結(jié)合mRNA差示技術(shù)研究紫杉醇生物合成機(jī)制[J].中國(guó)新藥雜志,2000(04):224-228.
[49]胡新生,韓一凡,邱德有.樹(shù)木木質(zhì)素含量的遺傳變異研究進(jìn)展[J].林業(yè)科學(xué)研究,1999,12(6):563-571
[50]李明亮,韓一凡,邱德有,李凝,田穎川.ACC合酶cDNA克隆及其對(duì)美洲黑楊體內(nèi)乙烯產(chǎn)生的反義抑制[J].林業(yè)科學(xué),1999(03):3-5.
[51]邱德有,李如玉.紫杉醇生物合成的研究進(jìn)展[J].生命科學(xué),1998,6:316-320.
[52]邱德有,李如玉,李鈴.紅豆杉及南方紅豆杉體細(xì)胞胚胎發(fā)生的研究[J].林業(yè)科學(xué),1998,34(6):50-54.
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[54]邱德有,韓一凡.紅豆杉器官、組織、細(xì)胞培養(yǎng)和基因工程的研究進(jìn)展[J].天然產(chǎn)物研究與開(kāi)發(fā),1998,10(1):90-98.
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[56]邱德有,朱微,朱至清.利用栝樓發(fā)根生產(chǎn)天花粉蛋白的研究[J].植物學(xué)報(bào),1996,38(06):439-443+511.
[57]邱德有,黃美娟,方曉華,朱澂,朱至清.一種云南紅豆杉內(nèi)生真菌的分離[J].真菌學(xué)報(bào),1994,13(04):314-316.
[58]邱德有,朱澂.植物的熱激蛋白[J].植物生理學(xué)通訊,1994(02):139-142.
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[60]邱德有, 1993, 利用轉(zhuǎn)基因植物生產(chǎn)有用的次生代謝物質(zhì). 見(jiàn):林金安.王宏良主編.植物科學(xué)綜論. 哈爾濱:東北林業(yè)大學(xué)出版社, 20-34.
[61]邱德有.石刁柏育種進(jìn)展[J].世界農(nóng)業(yè),1993(03):52-53.
[62]周維燕,邱德有,魏進(jìn)華.石刁柏花粉胚的發(fā)生及純合株的快速鑒定[J].北京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),1992(04):369-374.
發(fā)表中文會(huì)議論文:
[1]劉敏,邱德有,晁慧娟,董清華. 利用反向PCR方法克隆草莓多酚氧化酶基因及基因兩側(cè)非編碼序列[C]. 科技部863計(jì)劃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域辦公室.全國(guó)植物分子育種研討會(huì)摘要集.科技部863計(jì)劃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域辦公室:中國(guó)作物學(xué)會(huì),2009:32.
[2]劉敏,晁慧娟,邱德有,董清華. 草莓多酚氧化酶基因的克隆、反義表達(dá)載體構(gòu)建及轉(zhuǎn)化煙草的研究[C]. 科技部863計(jì)劃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域辦公室.全國(guó)植物分子育種研討會(huì)摘要集.科技部863計(jì)劃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域辦公室:中國(guó)作物學(xué)會(huì),2009:137.
[3]劉敏,滕文靜,晁慧娟,董清華,邱德有. 草莓果實(shí)外源基因瞬時(shí)表達(dá)系統(tǒng)的建立[C]. 科技部863計(jì)劃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域辦公室.全國(guó)植物分子育種研討會(huì)摘要集.科技部863計(jì)劃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域辦公室:中國(guó)作物學(xué)會(huì),2009:138.
[4]李鳳嵐,馬小軍,邱德有. 曼地亞紅豆杉細(xì)胞高效轉(zhuǎn)基因體系的建立[C]. 科技部863計(jì)劃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域辦公室.全國(guó)植物分子育種研討會(huì)摘要集.科技部863計(jì)劃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域辦公室:中國(guó)作物學(xué)會(huì),2009:139.
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