科學(xué)研究：

研究方向：

主要從事計(jì)算化學(xué)生物學(xué)的研究。

承擔(dān)科研項(xiàng)目情況：

承擔(dān)或參與國家自然科學(xué)基金委、科技部、中國科學(xué)院以及上海市科委在研項(xiàng)目多項(xiàng)。

1． 國家自然科學(xué)基金委青年科學(xué)基金一項(xiàng)，2006-2008。

2． 中國科學(xué)院優(yōu)秀博士學(xué)位論文科研啟動(dòng)專項(xiàng)資金一項(xiàng)，2006-2008。

資料更新中……

科研成果：

1． 分子靶向藥物設(shè)計(jì)方法的研究及應(yīng)用，2010年獲藥明康德“生命化學(xué)研究獎(jiǎng)”三等獎(jiǎng)。

資料更新中……

發(fā)明專利：

1． 一類磷脂酶甲2的抑制劑及其制備方法和用途 來魯華; 馮亞兵; 劉瑩; 王任小; 周廣彥 【中國專利】北京大學(xué) 2002-07-10

2． 一種噻唑聯(lián)吡唑酮類化合物及其作為Bcl-2家族蛋白拮抗劑的應(yīng)用 王任小; 馬大為; 李勛; 孫威; 周炳城; 石志敏; 張興龍; 朱翠俠; 李雯雯 【中國專利】中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所 2009-01-14

3． 一種噻唑并[3,2-a]嘧啶類化合物及其作為Bcl-2家族蛋白拮抗劑的應(yīng)用 王任小; 俞飚; 李勛; 周炳城; 石志敏; 張興龍; 朱翠俠; 李雯雯 【中國專利】中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所 2009-01-21

4． 2-芳基-6-芳基’-葡萄糖苷類化合物及其制備方法與應(yīng)用 王任小; 俞飚; 史合方; 李勛; 周炳城; 李嫣; 石志敏; 張興龍; 朱翠俠; 李雯雯 【中國專利】中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所 2009-01-21

5． 芳香胺類衍生物或其類似物及其應(yīng)用 葉德泳; 王任小; 張亞; 林賦; 鄧曉東; 李勛; 周璐; 鄭雪雁 復(fù)旦大學(xué); 【中國專利】復(fù)旦大學(xué); 中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所 2011-03-30

計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)申請：

1. 中科院上海有機(jī)化學(xué)研究所，化學(xué)結(jié)構(gòu)自動(dòng)識(shí)別軟件I-interpret v1.0，登記號(hào)：2007SR15399.

2. 中科院上海有機(jī)化學(xué)研究所，脂水分配系數(shù)預(yù)測軟件XLOGP v3.0，登記號(hào)：2008SR05200.

3. 中科院上海有機(jī)化學(xué)研究所，蛋白-配體復(fù)合物親合性PDBbind-CN數(shù)據(jù)庫系統(tǒng) v2008，登記號(hào)：2008SR34921.

4. 中科院上海有機(jī)化學(xué)研究所，分子設(shè)計(jì)ITMD軟件 v1.0，登記號(hào)：2008SR34922.

5. 中科院上海有機(jī)化學(xué)研究所，蛋白-配體親合性預(yù)測X-SCORE軟件 v2.0，登記號(hào)：2008SR34923.

6. 中科院上海有機(jī)化學(xué)研究所，先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)及結(jié)構(gòu)優(yōu)化軟件AT&T v1.0，登記號(hào)：2009SR061028.

7. 中科院上海有機(jī)化學(xué)研究所，CCBG-CMS化合物管理系統(tǒng)軟件v1.0，登記號(hào)：2009SR061029.

論文專著：

發(fā)表學(xué)術(shù)論文80余篇。

出版專著：

資料更新中……

發(fā)表英文論文：

1. Li, Y.; Liu, Z.; Wang, R.*, “Test MM-PB/SA on True Conformational Ensembles of Protein-Ligand Complexes”, J. Chem. Inf. Model. 2010, 50, 1682-1692.

2. Lin, F.; Wang, R.*, “Systematic Derivation of AMBER Force Field Parameters Applicable to Zinc”, J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 1852-1870.

3. Cheng, T.; Liu, Z.; Wang, R.*, “A Knowledge-Based Strategy for Improving the Accuracy of Scoring Functions in Binding Affinity Prediction”, BMC Bioinformatics, 2010, 11, 193-208.

4. Li, X.; Li, Y.; Cheng, T.; Liu, Z.; Wang, R.*, “Evaluation of the Performance of Four Molecular Docking Programs on a Diverse Set of Protein-Ligand Complexes”, J. Comp. Chem. 2010, 31, 2109-2125.

5. Shi, H.; Zhou, B.; Li, W.; Shi, Z.; Yu, B.*; Wang, R.*, "Synthesis and Anti-tumor Activities of Methyl 2-O-Aryl-6-O-Aryl’-D-Glucopyranosides", Bioorg. Med. Chem. Lett., 2010, 20, 2855-2858.

6. Li, X.; Liu, Z.; Li, Y.; Li, J.; Li, J.; Wang, R.*, “A Statistical Survey on the Binding Constants of Covalently Bound Protein-Ligand Complexes”, Mol. Informatics, 2010, 29, 87-96.

7. Zheng, F.; Lin, F.; Wang, R.; Qing, F.-L. “Synthesis and conformational analysis of D-2-deoxy-2,2-difluoro-4-dihydro-4-thionucleosides”, Org. Biomol. Chem., 2010, 8, 163-170.

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10. Zhang, X.; Li, X.; Wang, R.* “Interpretation of the Binding Affinities of PTP1B Inhibitors with the MM-GB/SA method and the X-Score Scoring Function”, J. Chem. Inf. Model. 2009, 49, 1033-1048. (cover story)

11. Li, Y.; Zhou, B.; Wang, R.* “Rational Design of Tamiflu Derivatives Targeting at the Open Conformation of Neuraminidase Subtype 1”, J. Mol. Graph. Model. 2009, 28, 203-219.

12. Li, X.; Wang, R.* “Automatic Identification of Antibodies in the Protein Data Bank”, Chinese Journal of Chemistry, 2009, 27, 23-28.

13. Wang, K.; Wu, Y.-S.; Wang, G.-T.; Wang, R.-X.; Jiang, X.-K.; Fu, H.-B.; Li, Z.-T., "Hydrogen bonding-mediated foldamer-bridged zinc porphyrin-C60 dyads: ideal face-to-face orientation and tunable donor–acceptor interaction", Tetrahedron, 2009, 65, 7718–7729.

14. Zhu, Y.-Y.; Wang, G.-T.; Wang, R.-X.; Li, Z.-T. "Intramolecular Six-Membered and Three-Center C-H-O Hydrogen Bonding in 1,4-Diphenyl-1,2,3-Triazoles", Cryst. Growth Des., 2009, 9, 4778–4783.

15. Liu, Z. G.; Wang, G. T.; Li, Z. T.; Wang, R.* “Geometrical Preferences of the Hydrogen Bonds on Protein-Ligand Binding Interface Derived from Statistical Surveys and Quantum Mechanics Calculations”, J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 1959–1973.

16. Lin, F.; Wang, R.* “Molecular modeling of the three-dimensional structure of GLP-1R and its interactions with several agonists”, J. Mol. Model. 2008, 15, 53-65.

17. Cai, W.; Wang, G. T.; Du, P.; Wang, R. X.; Jiang, X. K.; Li, Z.T.* “Foldamer Organogels: A Circular Dichroism Study of Glucose-Mediated Dynamic Helicity Induction and Amplification”, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 13450–13459.

18. Yeang, C.; Varshney, S.; Wang, R.; Zhang Y.; Ye D.Y.; Jiang, X. C.* “The domain responsible for sphingomyelin synthase (SMS) activity”, Biochimica et Biophysica Acta-Molecular and Cell Biology of Lipids, 2008, 1781, 610-617.

19. Cheng, T.; Zhao, Y.; Li, X.; Lin, F.; Xu, Y.; Zhang, X.; Li, Y.; Wang, R.*; Lai, L. “Computation of Octanol-Water Partition Coefficients by Guiding an Additive Model with Knowledge”, J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 2140-2148.

20. Zhao, Y.; Cheng, T.; Wang, R.* “Automatic Perception of Organic Molecules Based on Essential Structural Information”, J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 1379-1385.

21. Wang, R.*; Lin, F.; Xu, Y.; Cheng, T. “I-SOLV: A new surface-based empirical model for computing solvation free energies”, J. Mol. Graph. Model. 2007, 26, 368-377.

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23. Li, C.; Wang, G.; Yi, H.; Jiang, X.; Li, Z.*; Wang, R.* “Diastereomeric Recognition of Chiral Foldamer Receptors for Chiral Glucoses”, Org. Lett. 2007, 9, 1797-1800.

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25. Tang, G.; Ding, K.; Nikolovska-Coleska, Z.; Yang, C.-Y.; Qiu, S.; Shangary, S.; Wang, R.; Guo, J.; Gao, W.; Meagher, J.; Stuckey, J.; Krajewski, K.; Jiang, S.; Roller, P. P.; Wang, S.* “Structure-Based Design of Flavonoid Compounds As a New Class of Small-Molecule Inhibitors of the Anti-apoptotic Bcl-2 Proteins”, J. Med. Chem. 2007, 50, 3163-3166.

26. Tang, G.-Z.; Yang, C.-Y.; Nikolovska-Coleska, Z.; Guo, J.; Qiu, S.; Wang, R. X.; Gao, W.; Wang, G.-P.; Stuckey, J.; Krajewski, K.; Jiang, S.; Roller, P. P.; Wang, S. M.* “Pyrogallol-based molecules as potent inhibitors of the antiapoptotic Bcl-2 proteins”, J. Med. Chem. 2007, 50, 1723-1726.

27. Lu, Y.; Wang, R.; Yang, C.-Y.; Wang, S.* “Analysis of ligand-bound water molecules in high-resolution crystal structures of protein-ligand complexes”. J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 668-675.

28. Zhang M.C.; Ling, Y.; Yang, C.-Y.; Liu, H. P.; Wang, R. X.; Wu, X. H.; Ding, K.; Zhu, F.; Griffith, B. N.; Mohammad, R. M.; Wang, S. M.*; Yang, D. J. “A novel Bcl-2 small molecule inhibitor 4-(3-methoxy-phenylsulfannyl)-7-nitro-benzofurazan-3-oxide (MNB)-induced apoptosis in leukemia cells”. Annals. Hematology, 2007, 86, 471-481.

29. Xu, Y.; Wang, R.* “A Computational Analysis of the Binding Affinities of FKBP12 Inhibitors Using the MM-PB/SA Method”, Proteins, 2006, 64, 1058-1068.

30. Yu, S.; Pu, X.; Cheng, T.; Wang, R.; Ma, D.* “Total Synthesis of Clavepictines A and B and Pictamine”, Org. Lett. 2006, 8, 3179-3182.

31. Ma, D.*; Jiang, Y.; Chen, F.; Gong, L.-k.; Ding, K.; Xu, Y.; Wang, R.; Ge, A.; Ren, J.; Li, J.; Li, J.; Ye, Q. “Selective Inhibition of Matrix Metalloproteinase Isozymes and in Vivo Protection against Emphysema by Substituted -Keto Carboxylic Acids”, J. Med. Chem. 2006, 49, 456-458.

32. Wang, G.; Nikolovska-Coleska, Z.; Yang, C.-Y.; Wang, R.; Tang, G.; Guo, J.; Shangary, S.; Qiu, S.; Gao, W.; Yang, D.; Meagher, J.; Stuckey, J.; Krajewski, K.; Jiang, S.; Roller, P. P.; Abaan, H. O.; Tomita, Y.; Wang, S.* “Structure-Based Design of Potent Small-Molecule Inhibitors of Anti-Apoptotic Bcl-2 Proteins”, J. Med. Chem., 2006, 49, 6139-6142.

33. Yang, C.-Y.; Wang, R.; Wang, S.* “M-Score: A Knowledge-Based Potential Scoring Function Accounting for Protein Atom Mobility”, J. Med. Chem. 2006, 49, 5903-5911.

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37. Wang R.; Lu Y.; Fang X.; Wang S.* “An Extensive Test of 14 Scoring Functions Using the PDBbind Refined Set of 800 Protein-Ligand Complexes”, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2004, 44, 2114-2125.

38. Real P. J.; Cao, Y.; Wang R.; Nikolovska-Coleska Z.; Sanz-Ortiz J.; Wang S.; Fernandez-Luna J. L.* “Breast cancer cells can evade apoptosis-mediated selective killing by a novel small molecule inhibitor of Bcl-2”, Cancer Research, 2004, 64, 7947-7953.

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41. Nikolovska-Coleska, Z.; Xu, L.; Hu, Z.; Tomita, Y.; Li, P.; Roller, P. P.; Wang, R.; Fang, X.; Guo, R.; Zhang, M.; Lippman, M. E.; Yang, D.; Wang, S.* “Discovery of Embelin as a Cell-Permeable, Small-Molecular Weight Inhibitor of XIAP through Structure-Based Computational Screening of a Traditional Herbal Medicine Three-Dimensional Structure Database”, J. Med. Chem. 2004, 47, 2430-2440.

42. Gao, Y.; Wang, R.; Lai, L.* “Structure-based method for analyzing protein-protein interfaces”, J. Mol. Model. 2004, 10, 44-54.

43. Wang, R.; Lu, Y.; Wang, S.* “Comparative Evaluation of Eleven Scoring Functions for Molecular Docking”, J. Med. Chem. 2003, 46, 2287-2303.

44. Leach, A. G.; Wang, R.; Wohlhieter, G. E.; Khan, S. I.; Jung, M. E.; Houk, K. N.* “Theoretical Elucidation of Kinetic and Thermodynamic Control of Radical Addition Regioselectivity”, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 4271-4278.

45. Wang, R.; Lai, L.; Wang, S.* “Further development and validation of empirical scoring functions for structure-based binding affinity prediction”, J. Comput.-Aided Mol. Des. 2002, 16, 11-26.

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47. Wang, R.; Wang, S.* “How does consensus scoring work for virtual library screening? An idealized experiment”, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2001, 41, 1422-1426.

48. Rong, S.; Hu, Y.; Enyedy, I.; Powis, G.; Meuillet, E. J.; Wu, X.; Wang, R.; Wang, S.*; Kozikowski, A. P. “Molecular Modeling Studies of the Akt PH Domain and Its Interaction with Phosphoinositides”, J. Med. Chem. 2001, 44, 898-908.

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51. Liu, Y.; Feng, Y.; Gao, Y.; Wang, R.; Lai, L.* “Structure-based design and synthesis of novel type quinoline as secretory PLA(2) inhibitors”, Acta Phys.-Chim. Sinica 2001, 59, 1751-1755.

52. Chen, J.; Deng, Q.; Wang, R.; Houk, K. N.*; Hilvert, D.* "Shape Complementarity, Binding Site Dynamics, and Transition State Stabilization: A Theoretical Study of Diels-Alder Catalysis by Antibody 1E9", ChemBioChem 2000, 1, 255-261.

53. Wang, R.; Gao, Y.; Lai, L.* "LigBuilder: A Multiple-Purposed Program for Structure-Based Drug Design", J. Mol. Model. 2000, 6, 498-516.

54. Wang, R.; Gao, Y.; Lai, L.* "Calculating Partition Coefficients by Atom-Additive Method", Perspective in Drug Discovery & Design. 2000, 19, 47-66.

55. Li, W.; Liang, S.; Wang, R.; Lai, L.*; Han, Y. "Exploring the Conformational Diversity of Loops on Conserved Frameworks", Protein Eng. 1999, 12, 1075-1086.

56. Tao, P.; Wang, R.; Lai, L*. "Calculating Partition Coefficients of Peptides by the Addition Method", J. Mol. Model. 1999, 5, 189-195.

57. Tao, P.; Wang, R.; Lai, L*. "Calculating Partition Coefficients of Peptides by Amino Acid Addition Model", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1999, 15, 449-453.

58. Zhu, B.*; Zhang, P.; Wang, R.; Liu, Z.; Lai, L. “Phase separation and crystallization in mixed monolayers of FC and HC surfactants”, Colloids & Surfaces A 1999, 157, 63-71.

59. Wang, R.; Liu, L.; Lai, L.*; Tang, Y. "SCORE: A New Empirical Method for Structure-Based Estimation of Binding Affinities", J. Mol. Model. 1998, 4, 379-394.

60. Wang, R.; Gao, Y.; Liu, L.; Lai, L.* "All-Orientation Search and All-Placement Search in Comparative Molecular Field Analysis", J. Mol. Model., 1998, 4, 276-283.

61. Wang, R.; Li, W.; Lai, L.*; Tang, Y. "Estimating the Binding Affinities for Enzyme-Ligand Complexes", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1998, 14, 826-832.

62. Wang, R.; Liu, L.; Lai, L.*; Tang, Y. "Studying the Structure-Affinity Relationship of Thrombin Inhibitors", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1998, 14, 887-892.

63. Wang, R.; Feng, Y.; Lai, L.*; Tang, Y. "Studying the Structure-Affinity Relationship of Indole-Based Inhibitors for Phospholipase A2", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1998, 14, 893-897.

64. Wang, R.; Gao, Y.; Liu, L.; Lai, L.* "Role of Compound Orientation in CoMFA Studies", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1998, 14, 1-4.

65. Wang, R.; Fu, Y.; Lai, L.* "A New Atom-Additive Method for Calculating Partition Coefficients", J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1997, 37, 615-621.

66. Liu, L.; Wang, R.; Lai, L.*; Li, C.* "3D-QSAR and Pharmacophore Modeling of Growth Hormone Secretagogues", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1997, 13, 1090-1096.

67. Wang, R.; Fu, Y.; Lai, L.* "A New Method for Calculating Partition Coefficients of Organic Compounds", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1997, 13, 1-4.

68. Luo, Z.; Wang, R.; Lai, L.* "RASSE: A new Method for Structure-Based Drug Design", J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1996, 36, 1187-1194.

69. Lai, L.*; Wang, R.; Tang, Y. "A New Model for Calculating logP for Organic Compounds", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1994, 10, 963-965.

70. Wang, Y.; Li, J.; Wang, R.* "Computational Approaches to Estimate Octanol-Water Partition Coefficient and Water Solubility of Organic Compounds", Acta Phys.-Chim. Sinica (物理化學(xué)學(xué)報(bào)), 2010,26, 1742-1754

71. Li, Y.; Wang, R.* “Theoretical approaches to the prediction of the biological targets of small-molecular compounds based on chemogenomic information”, Chinese Bulletin of Life Sciences (生命科學(xué)), 2009, 21, 400-407

發(fā)表中文論文：

1 化合物的空間取向?qū)�CoMFA結(jié)果的影響 王任小; 高瀅; 劉亮; 來魯華 北京大學(xué)物理化學(xué)研究所 【期刊】物理化學(xué)學(xué)報(bào) 1998-01-15

2 酶-配體復(fù)合物親和性的計(jì)算 王任小; 李維忠; 來魯華; 唐有祺 北京大學(xué)物理化學(xué)研究所 【期刊】物理化學(xué)學(xué)報(bào) 1998-09-15

3 凝血酶抑制劑的結(jié)構(gòu)與活性的關(guān)系 王任小; 劉亮; 來魯華; 唐有祺 北京大學(xué)物理化學(xué)研究所 【期刊】物理化學(xué)學(xué)報(bào) 1998-10-15

4 磷脂酶A_2吲哚類抑制劑的結(jié)構(gòu)和活性關(guān)系 王任小; 馮亞彬; 來魯華; 唐有祺 北京大學(xué)物理化學(xué)研究所 【期刊】物理化學(xué)學(xué)報(bào) 1998-10-15

5 有機(jī)化合物脂水分配系數(shù)和溶解度的計(jì)算方法 王艷玲; 李婕; 王任小 中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所; 生命有機(jī)化學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 【期刊】物理化學(xué)學(xué)報(bào) 2010-07-15

6 三種Bcl-2家族蛋白的表達(dá)、純化及活性分析 朱翠俠; 李勛; 李雯雯; 石志敏; 周佳海; 王任小 中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所生命有機(jī)化學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 【期刊】生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)雜志 2010-08-25

7 應(yīng)用化學(xué)基因組信息預(yù)測小分子化合物的潛在生物靶標(biāo)的理論方法 李嫣; 王任小 中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所生命有機(jī)化學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 【期刊】生命科學(xué) 2009-06-15

8 國內(nèi)外生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫服務(wù)新進(jìn)展 李維忠; 王任小; 林大威; 毛鳳樓; 韓玉真; 來魯華 北京大學(xué)物理化學(xué)研究所 【期刊】生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展 1999-02-25

9 用氨基酸加和法計(jì)算多肽的脂水分配系數(shù) 陶鵬; 王任小; 來魯華 北京大學(xué)物理化學(xué)研究所 【期刊】物理化學(xué)學(xué)報(bào) 1999-05-15

10 分析蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用界面的新方法 高瑩; 王任小; 來魯華 北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院物理化學(xué)研究所; 北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院物理化學(xué)研究所 分子動(dòng)態(tài)與穩(wěn)態(tài)結(jié)構(gòu)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 分子動(dòng)態(tài)與穩(wěn)態(tài)結(jié)構(gòu)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 北京100 【期刊】物理化學(xué)學(xué)報(bào) 2002-08-30

11 有機(jī)化合物脂水分配系數(shù)logP的計(jì)算 來魯華; 王任小; 唐有祺 北京大學(xué)物理化學(xué)研究所 【期刊】物理化學(xué)學(xué)報(bào) 1994-11-30

12 計(jì)算有機(jī)化合物脂水分配系數(shù)的新方法 王任小; 傅瑛; 來魯華 北京大學(xué)物理化學(xué)研究所 【期刊】物理化學(xué)學(xué)報(bào) 1997-01-30

13 促生長激素釋放素三維定量構(gòu)效關(guān)系及藥效團(tuán)模型 劉亮; 王任小; 來魯華; 李崇熙 北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院 【期刊】物理化學(xué)學(xué)報(bào) 1997-12-30

榮譽(yù)獎(jiǎng)勵(lì)：

1． 2001年獲美國Cap CURE癌癥基金會(huì)Young Investigator Award。

2． 2001年獲中國教育部“全國優(yōu)秀博士學(xué)位論文”獎(jiǎng)。

3． 2006年獲上海市科委“浦江人才”獎(jiǎng)。

4． 2006年入選中國科學(xué)院“百人計(jì)劃”擇優(yōu)支持。

5． 2009年獲Eli Lilly公司亞洲優(yōu)秀畢業(yè)研究生導(dǎo)師獎(jiǎng)。

6． 2009年獲明治乳業(yè)生命科學(xué)獎(jiǎng)。

7． 2009年獲中國藥學(xué)會(huì)-施維雅青年藥物化學(xué)家獎(jiǎng)。

8． 2010年獲SCOPUS“青年科學(xué)之星”榮譽(yù)稱號(hào)。

9． 2010年獲藥明康德“生命化學(xué)研究獎(jiǎng)”三等獎(jiǎng)。

資料更新中……

媒體報(bào)道：

險(xiǎn)峰縱然三千丈堅(jiān)信自有登頂時(shí)——記中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所課題組長王任小研究員

一個(gè)經(jīng)濟(jì)實(shí)力雄厚、擁有13億人口的泱泱大國，醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的規(guī)模位居世界前列，但是創(chuàng)制新藥的能力卻與西方發(fā)達(dá)國家存在明顯差距，這是我國醫(yī)藥行業(yè)最大的隱痛。這種狀況深深地觸動(dòng)了不少在生物醫(yī)藥領(lǐng)域前行的科研工作者，這其中就包括在中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所工作的王任小研究員。王任小研究員目前為生命有機(jī)化學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室課題組長，博士生導(dǎo)師。目前他正領(lǐng)導(dǎo)著他的課題組，開展藥物分子設(shè)計(jì)以及化學(xué)生物學(xué)等方面的基礎(chǔ)研究。其研究成果為藥物分子設(shè)計(jì)提供了更先進(jìn)的工具，對(duì)于提高我國新藥創(chuàng)制領(lǐng)域的整體技術(shù)水平，追趕世界先進(jìn)水平都具有非�，F(xiàn)實(shí)的意義。

王任小研究員于1989年保送入北京大學(xué)化學(xué)學(xué)院學(xué)習(xí)，于1994年獲得理學(xué)學(xué)士學(xué)位。同年保送為北京大學(xué)化學(xué)學(xué)院研究生，師從唐有祺院士，從事計(jì)算機(jī)輔助藥物分子設(shè)計(jì)方面的研究，于1999年7月獲得理學(xué)博士學(xué)位。1999年至2005年先后在美國加利福尼亞大學(xué)洛杉磯分�；瘜W(xué)系、美國喬治敦大學(xué)醫(yī)學(xué)中心以及美國密西根大學(xué)醫(yī)學(xué)院進(jìn)行博士后研究以及工作。

王任小于2005年入選中國科學(xué)院“百人計(jì)劃”，其后加入中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所工作至今。之所以選擇回國工作，用王任小研究員的話說是懷抱著報(bào)效祖國的夢想以及對(duì)我國在新藥創(chuàng)制領(lǐng)域現(xiàn)狀的一種不甘心�；貒�之后，王任小研究員憑借扎實(shí)的學(xué)術(shù)功底、與國際水平接軌的豐富科研經(jīng)驗(yàn)以及中科院上海有機(jī)化學(xué)研究所先進(jìn)的科研設(shè)備和技術(shù)條件，很快就領(lǐng)導(dǎo)課題組打開了局面，取得了豐碩的科研成果。

前沿學(xué)科閃耀科學(xué)光芒

當(dāng)今隨著各種基礎(chǔ)學(xué)科的發(fā)展，新藥研發(fā)早已進(jìn)入了理性藥物設(shè)計(jì)階段。與以往主要依靠盲目篩選發(fā)現(xiàn)活性化合物不同，合理藥物設(shè)計(jì)充分依據(jù)生物化學(xué)、酶學(xué)、分子生物學(xué)、遺傳學(xué)信息學(xué)以及計(jì)算化學(xué)等學(xué)科的研究成果，針對(duì)這些基礎(chǔ)研究中所揭示的包括酶、受體、離子通道及核酸等潛在的藥物作用靶點(diǎn)以及藥物作用的生理機(jī)制，通過參考內(nèi)源性配體或活性天然產(chǎn)物的化學(xué)結(jié)構(gòu)特征等方法，設(shè)計(jì)出合理的藥物分子。

計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)（computer-aideddrugdesign,CADD）的出現(xiàn)使得理性藥物設(shè)計(jì)取得了重大的突破。計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)是指借助計(jì)算機(jī)技術(shù)，依靠分子模擬、化學(xué)信息學(xué)和生物信息學(xué)等技術(shù)手段，對(duì)有機(jī)小分子配體與生物大分子受體相互作用、藥物分子的結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系、疾病的生物靶標(biāo)分子的性質(zhì)等進(jìn)行計(jì)算、分析和預(yù)測，從而指導(dǎo)新型藥物的發(fā)現(xiàn)，減少盲目性，提高新藥研發(fā)的整體效率。該學(xué)科是化學(xué)、生物學(xué)、藥學(xué)、物理學(xué)以及計(jì)算機(jī)科學(xué)的交叉學(xué)科，對(duì)于研究者的專業(yè)基礎(chǔ)提出了極大的挑戰(zhàn)。該學(xué)科自20世紀(jì)80年代以來得到蓬勃發(fā)展，目前已經(jīng)具備完整的體系。它為合理設(shè)計(jì)藥物分子提供了理論依據(jù)和方向，降低了藥物開發(fā)的成本，縮短了藥物開發(fā)的時(shí)間，在新藥研發(fā)中已經(jīng)得到了醫(yī)藥工業(yè)界和學(xué)術(shù)界的廣泛應(yīng)用，為人類攻克一些頑癥提供了新的思路和成功的希望。

王任小研究員在攻讀博士學(xué)位時(shí)就確定了計(jì)算機(jī)輔助藥物分子設(shè)計(jì)作為其研究主攻方向并堅(jiān)持至今。王任小研究員擅長以分子模擬、生物信息學(xué)和化學(xué)信息學(xué)為手段，研究重要生物大分子的功能和機(jī)制以及有機(jī)小分子與生物大分子之間的相互作用。自參加科研工作十余年來，他主持發(fā)展了多種藥物分子設(shè)計(jì)中的關(guān)鍵方法，其中近年來的代表工作有：蛋白-配體親合性打分函數(shù)X-Score、有機(jī)化合物脂水分配系數(shù)計(jì)算方法XLOGP、先導(dǎo)化合物結(jié)構(gòu)優(yōu)化方法AT&T軟件和PDBbind-CN數(shù)據(jù)庫。這些成果已獲得國家計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)9項(xiàng)，擁有來自世界上三十多個(gè)國家超過4000名注冊用戶。這些用戶中許多來自國際上著名的大學(xué)、研究機(jī)構(gòu)以及大型醫(yī)藥公司，形成了廣泛的國際影響。

另外，王任小研究員也具有豐富的藥物分子設(shè)計(jì)實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)。他選擇與重大疾病過程相關(guān)的生物大分子作為靶標(biāo)，運(yùn)用計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)方法并結(jié)合必要的化學(xué)和生物實(shí)驗(yàn)手段，設(shè)計(jì)可以有效調(diào)節(jié)這些靶標(biāo)分子功能的有機(jī)小分子化合物，并成功獲得了多類具有活性的化合物，近年來申請國家發(fā)明專利6項(xiàng)。王任小研究員課題組已經(jīng)初步建立了理論結(jié)合實(shí)踐的整體研究框架，并獲得了豐碩的科研成果。

勵(lì)精圖治催熟累累碩果

科研道路從來不是一帆風(fēng)順的坦途，要想取得好的成績也絕不可能一蹴而就。王任小研究員深知“成功是99﹪的汗水加上1﹪的靈感”。在他所從事的基礎(chǔ)科學(xué)研究領(lǐng)域中就更是如此。他從不好高騖遠(yuǎn)、貪圖虛名，而是奉獻(xiàn)科學(xué)，埋頭苦干，踏踏實(shí)實(shí)地走好每一步。為了一個(gè)好的構(gòu)想，他可以廢寢忘食地在實(shí)驗(yàn)室里潛心鉆研數(shù)周；為了論證一種可能，他可以不畏艱辛地驗(yàn)證一次又一次。失敗了，不氣餒，總結(jié)教訓(xùn)，重新再來；成功了，不滿足，汲取經(jīng)驗(yàn)，再攀高峰……

“寶劍鋒從磨礪出，梅花香自苦寒來�！倍嗄甑男燎诳蒲袚Q來的是一系列豐碩的成果：王任小研究員已在Proc.Natl.Acad.Sci.,J.Am.Soc.Chem.,J.Med.Chem.,J.Chem.Inf.Model.等國際國內(nèi)核心刊物上發(fā)表學(xué)術(shù)論文70余篇，合計(jì)被引用超過2700次，H指數(shù)為23。王任小研究員早在2001年就獲得過中國教育部頒發(fā)的“全國百篇優(yōu)秀博士論文”獎(jiǎng)，同年又獲得美國CapCURE基金會(huì)頒發(fā)的青年科學(xué)家獎(jiǎng)。自回國在中科院上海有機(jī)化學(xué)研究所擔(dān)任課題組長開展科研工作以來，王任小研究員先后獲得了中科院“百人計(jì)劃”擇優(yōu)支持以及上海市科委“浦江人才”計(jì)劃支持。

由于工作成績優(yōu)異，近年來他又先后獲得了數(shù)項(xiàng)競爭性強(qiáng)的知名科研獎(jiǎng)項(xiàng)。2009年王任小研究員獲得第十二屆中國藥學(xué)會(huì)“施維雅青年藥物化學(xué)獎(jiǎng)”。中國藥學(xué)會(huì)“施維雅青年藥物化學(xué)獎(jiǎng)”是由中國藥學(xué)會(huì)與法國施維雅研究院共同設(shè)立的，每年評(píng)選一次，旨在鼓勵(lì)中國優(yōu)秀青年藥物化學(xué)工作者立足于中國國內(nèi)，致力于中國新藥的研究。該獎(jiǎng)設(shè)立十年多來，有力推動(dòng)了我國優(yōu)秀青年藥物化學(xué)工作者的健康成長和發(fā)展。2010年，王任小研究員獲得了“SCOPUS青年科學(xué)之星”獎(jiǎng)項(xiàng)。SCOPUS尋找青年科學(xué)之星活動(dòng)于2009年由中國科學(xué)院科學(xué)新聞雜志以及愛思唯爾公司科技部聯(lián)合設(shè)立，是近年來中國第一個(gè)圍繞40歲以下青年科學(xué)家舉辦的評(píng)選活動(dòng)。該獎(jiǎng)項(xiàng)的評(píng)審根據(jù)公開、公平、公正的原則，獎(jiǎng)勵(lì)本年度授予環(huán)境科學(xué)、生命科學(xué)、信息科學(xué)、氣候變化科學(xué)以及材料科學(xué)領(lǐng)域共50名青年科學(xué)家。在本年度的評(píng)選中，王任小研究員入圍生命科學(xué)領(lǐng)域前三甲，榮獲“輝瑞青年科學(xué)之星成長獎(jiǎng)”。同年王任小研究員又獲得了藥明康德“生命科學(xué)研究獎(jiǎng)”，這同樣是份量很重的一個(gè)獎(jiǎng)項(xiàng)。該獎(jiǎng)項(xiàng)由我國生物醫(yī)藥界的旗艦級(jí)公司藥明康德新藥開發(fā)有限公司設(shè)立，獎(jiǎng)勵(lì)在化學(xué)、生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、藥學(xué)及相關(guān)科技領(lǐng)域中的科學(xué)研究、技術(shù)創(chuàng)新與開發(fā)、研究成果推廣應(yīng)用、實(shí)現(xiàn)高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)化、科學(xué)技術(shù)普及等方面取得成果或者做出貢獻(xiàn)的在�；蛟诼殐�(yōu)秀青年科技人才。自2007年設(shè)立以來，該獎(jiǎng)項(xiàng)每年評(píng)選一次。2010年該獎(jiǎng)項(xiàng)頒發(fā)給17名我國在藥物化學(xué)領(lǐng)域中做出杰出貢獻(xiàn)的科學(xué)家。王任小研究員是這批獲獎(jiǎng)?wù)咧斜容^年輕的，充分說明了他不俗的科研實(shí)力。

由于他的科研工作的廣泛國際影響，王任小研究員目前受邀擔(dān)任國際刊物《ChemMedChem》和《MolecularInformatics》的顧問編委，并擔(dān)任《J.Med.Chem.》《J.Chem.Theor.Comput.》《J.Chem.Inf.Model.》《Med.Res.Rev.》等近20種國內(nèi)外核心學(xué)術(shù)期刊的審稿專家。他密切關(guān)注國際上相關(guān)研究的最新成果和動(dòng)向，并在國內(nèi)發(fā)表和傳播，沒有一絲懈怠。正是這種不斷進(jìn)取、不斷開拓、永不止步的精神，使他的課題組可以取得追蹤甚至趕超國際先進(jìn)水平的成果。

精英團(tuán)隊(duì)共鑄“科研利艦”

談到取得的成績，王任小研究員謙虛地說：“我之所以能取得一點(diǎn)成績，真的全靠我的團(tuán)隊(duì)”。王任小研究員領(lǐng)導(dǎo)的課題組由固定科研人員、博士后和研究生相結(jié)合組成，是一支年輕的、具有多學(xué)科專業(yè)知識(shí)的科研團(tuán)隊(duì)。人才優(yōu)勢是這個(gè)科研團(tuán)隊(duì)的核心靈魂。目前王任小研究員課題組承擔(dān)以及參與多項(xiàng)國家自然科學(xué)基金委、科技部以及上海市科委的科研項(xiàng)目。在國家各級(jí)部門的資助以及各位成員的努力下，該課題組不懈進(jìn)取，為我國藥物分子設(shè)計(jì)學(xué)科的發(fā)展貢獻(xiàn)著一份不可或缺的力量。

王任小研究員課題組目前擁有充足的計(jì)算機(jī)硬件資源以及一批與國際水平接軌的分子模擬軟件。在計(jì)算機(jī)硬件資源方面，課題組擁有Linux集群式服務(wù)器2套（>400CPU）以及一批高性能圖形桌面工作站。在藥物分子設(shè)計(jì)軟件方面，該課題組擁有齊全的主流商用軟件如Sybyl、DiscoveryStudio/PipelinePilot、Schrodinger、MOE、分子對(duì)接軟件GOLD、量子化學(xué)軟件Gaussian09以及MDL數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)。MDL數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)內(nèi)容豐富，囊括了天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫、中草藥成份數(shù)據(jù)庫、毒性數(shù)據(jù)庫、代謝數(shù)據(jù)庫、CMC、MDDR等多種數(shù)據(jù)庫，能提供提供數(shù)百萬種有機(jī)化合物的信息。這些一流的硬件資源和軟件資源為王任小研究員課題組進(jìn)行高性能藥物分子設(shè)計(jì)提供了先進(jìn)的技術(shù)條件。同時(shí)，王任小研究員課題組也擁有必要的有機(jī)合成以及生物學(xué)實(shí)驗(yàn)設(shè)備。該課題組依托生命有機(jī)化學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室有利的外部環(huán)境，積極在有機(jī)合成、分子生物學(xué)以及結(jié)構(gòu)生物學(xué)等方面與其他課題組開展合作。王任小研究員課題組近年來從事抗腫瘤分子靶向藥物的研發(fā)，針對(duì)Bcl-2蛋白家族等潛在藥物靶標(biāo)，目前已獲得了多種類型的活性先導(dǎo)化合物，已經(jīng)申請國家發(fā)明專利多項(xiàng)，并在積極將這些先導(dǎo)化合物發(fā)展為候選藥物。

在擁有一流的硬件資源和軟件資源、雄厚的科研實(shí)力的前提下，王任小研究員正準(zhǔn)備廣納賢才，讓更多有志于從事藥物分子設(shè)計(jì)以及新藥研發(fā)的科研人員加入課題組，進(jìn)一步發(fā)展和完善藥物分子設(shè)計(jì)的理論和方法，研究與重大疾病過程相關(guān)的生物靶標(biāo)，努力攻克新藥創(chuàng)制領(lǐng)域中的難題。

眾多優(yōu)秀人才齊聚一堂，如何才能最大限度地發(fā)揮出每個(gè)人的聰明才智和創(chuàng)造能力？王任小研究員表示：取長補(bǔ)短，交流合作是關(guān)鍵。做學(xué)問不是一個(gè)人閉門造車就行的。成功的經(jīng)驗(yàn)?zāi)贸鰜矸窒砜梢约ぐl(fā)出更多的創(chuàng)造靈感，精誠合作才會(huì)產(chǎn)生“1+1>2”的效應(yīng)。王任小研究員課題組內(nèi)部定期開展小組討論會(huì)，交流科研進(jìn)展。在小組討論會(huì)上，課題組成員交流各自的科研進(jìn)展，討論最新發(fā)表的重要論文。許多靈感就是在這樣的思維碰撞中產(chǎn)生的。課題組平時(shí)也會(huì)組織郊游、休閑和運(yùn)動(dòng)等集體活動(dòng)，一方面使課題組成員在緊張的工作之余得以放松，另一方面也增進(jìn)了課題組成員之間的和諧關(guān)系。王任小研究員課題組正是這樣注重交流、精誠合作、群策群力、銳意進(jìn)取，從而鑄造出一艘有戰(zhàn)斗力的“科研利艦”，攻克了一個(gè)又一個(gè)的科研難關(guān)。

莘莘年輕學(xué)子是科研工作未來的希望。尤其對(duì)于新興學(xué)科，讓剛剛接觸科研工作的研究生對(duì)其產(chǎn)生興趣，進(jìn)而深入學(xué)習(xí)和研究，是傳承學(xué)科、既往開來的必要環(huán)節(jié)。王任小研究員以培育英才為己任，以謙虛謹(jǐn)慎的治學(xué)態(tài)度、一絲不茍的科研精神、追求卓越的崇高理念，以身作則地感染、激勵(lì)著課題組中的研究生們。當(dāng)課題組中每一名研究生順利獲得博士或者碩士學(xué)位時(shí)，他們總是由衷地感嘆是王老師在過去幾年中給予了他們前進(jìn)的動(dòng)力，樹立了他們學(xué)習(xí)的榜樣。如今，從王任小研究員課題組畢業(yè)的學(xué)生有些在歐美著名大學(xué)或研究機(jī)構(gòu)中繼續(xù)深造，有些加盟知名醫(yī)藥公司投身新藥創(chuàng)制事業(yè)。

“路漫漫其修遠(yuǎn)兮，吾將上下而求索”。藥物分子設(shè)計(jì)研究具有深遠(yuǎn)的科學(xué)價(jià)值以及廣闊的應(yīng)用前景。王任小研究員憑借他對(duì)科學(xué)的熱愛，在科研之路上執(zhí)著前行，必定會(huì)攻克重大科學(xué)難題，實(shí)現(xiàn)他心中的夢想。

文章來源：《科學(xué)中國人》2011年第23期